# 非ステロイド性消炎鎮痛剤 (NSAIDs) が処方されることが多い。ただしこれまで安定した効果を持つ特効鎮痛剤は見つかっておらず、NSAIDsにて治癒軽快した例はきわめて少ない。
# 抗不安薬（フェノチアジン系、ブチロフェノン系、ベンズアミド系、ベンゾジアゼピン系）や三環系抗うつ薬トリプタノールなどが古くから有効とされている。デパス・コンスタンなど補助的に使う場合が多い。
# SSRI・SNRI（フルボキサミン、パロキセチン、ミルナシプラン、ヴェンラファキシンなど）による治療の報告も増えている。神経や精神状態の改善が症状を改善させるという臨床例が多く認められている。
# ノイロトロピンという特殊な作用機序を持つ下行性疼痛抑制系賦活型疼痛治療剤が長期間慢性的につづく疼痛に対しては有効とされている。ノイロトロピンを定期的に静脈注射するなどの療法も行われているが、線維筋痛症の痛みは個々人によって症状が異なるため、線維筋痛症に詳しく、これらの薬剤に熟知した専門医による処方が望まれる。
# 2007年米食品医薬品局（FDA）は米国ファイザー社リリカ（一般名：プレガバリン, Pregabalin）を初の線維筋痛症治療薬として承認した。プレガバリンは過剰興奮したニューロンを沈静化させる作用があるとされる。日本では糖尿病性末梢神経障害や帯状疱疹後神経痛，抗てんかん薬の三項目で承認される一方、線維筋痛症の病名では処方できない、個人輸入に頼らざるを得ない上、ジェネリック未発売のため薬価が高すぎるなどの問題がある。副作用は眠気、しびれ、目まい、浮腫、および無力症など。2008年ジェネリック発売。
# プレガバリンと作用が似ているガバペンチンもしばしば用いられる。
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